Getting more out of mass spectrophotometry-based proteomics using supervised learning approaches and on-the-fly data analysis

Les spectres générés par la MS/MS sont analysés par des outils informatiques. L’efficacité et la sensibilité de ces outils sont très critiques pour l’identification de peptides à partir des bases de données. Les algorithmes se basent sur plusieurs méthodes pour assigner masse spectrale à une séquence peptidique, entre autres :

- la corrélation croisée entre le spectre peptidique expérimental et le spectre théorique,

- les tags de séquence peptidiques (« peptides sequences tags »). Ces tags sont dérivés des spectres utilisés dans la recherche de séquences peptidiques connues.

Plusieurs outils s’appuient sur ces méthodes, entre autres : SEQUEST, PRoLUCID, DTASelect…etc